La bandera de Chiloé es un símbolo de respeto por la naturaleza, la historia y la cultura del Archipiélago de Chiloé.
El color azul y las estrellas representan el mar y la constelación Cruz del Sur como símbolos de la ubicación geográfica de Chiloé y de su cultura forjada por el mar y la navegación.
Los colores blanco y verde esmeralda representan la lluvia y el bosque nativo de Chiloé, siendo además los colores llevados por la legendaria goleta Ancud en 1843.
La bandera de Chiloé posee una proporción de 3:2 entre su longitud y su altura.
La mitad superior de la bandera es una franja horizontal de color azul.
La mitad inferior de la bandera se subdivide en dos franjas horizontales de igual altura, la superior de color blanco y la inferior de color verde esmeralda.
En el tercio izquierdo de la franja azul se sitúan cuatro estrellas de cinco puntas y de color blanco. El diámetro de cada estrella es una décima parte de la altura de la bandera y su disposición es mediante una cruz cuyo centro es igual al centro del tercio izquierdo de la franja azul:
Las tres primeras estrellas se sitúan en los brazos superior, izquierdo e inferior de la cruz, centradas a media distancia entre el centro de la cruz y los bordes de la franja azul.
La última estrella se sitúa en el brazo derecho de la cruz, centrada al doble de distancia del centro de la cruz en comparación con las tres primeras estrellas.
La bandera de Chiloé podrá ser usada libremente por toda persona, comunidad o institución, como símbolo de identidad y de respeto hacia el patrimonio natural y cultural de Chiloé.
Con base en este principio, se autoriza su libre uso como elemento identitario, cultural o turístico, incluyendo su utilización en artesanía, eventos, publicidad, entre otros.